Em mãos experientes, a CPRE apresenta um perfil de risco baixo, com taxas de resolução acima de 90% e eventos não planejados em menos de 5% dos casos, em sua maioria de caráter leve. É considerado a melhor ferramenta para avaliação das vias biliares, com taxas de especifidade superiores a 90%, melhor inclusive que a ressonância magnética. É considerada um procedimento minimamente invasivo, necessitando de menor tempo de internamento e com retorno mais rápido às atividades, se comparada à cirurgia, por exemplo. Não quer dizer que é um procedimento simples e isento de risco, mas na maioria das vezes o paciente recebe alta em 6h após o procedimento e pode retornar normalmente às suas atividades. Os principais eventos adversos relacionados ao procedimento são pancreatite, sangramento, infecções e perfurações. Outros eventos podem aparecer relacionados ao paciente – como por exemplo pressão alta ou diabetes descontrolados que aumentam risco de avc ou infarto – e relacionados à anestesia, embora sejam raros. Ainda mais raramente podemos ter eventos sérios, incluindo o risco de internamento prolongado em UTI e até mesmo o óbito.